В 1974 году поступил в Таджикский государственный медицинский институт, который закончил в 1980 году. После завершения обучения в клинической ординатуре, работал в Республиканском кардиологическом центре (г. Душанбе) С 1983 по 1986 г. г. проходил обучение в аспирантуре в I Ленинградском медицинском институте по завершению которой защитил кандидатскую диссертацию по специальности «кардиология». Далее работал ассистентом кафедры внутренних болезней № 1 Таджикского госмединститута.
С 1990 по 1995 годы обучался в докторантуре во Всероссийском кардиологическом научном центре (г. Москва), в 1995 году защитил докторскую диссертацию по специальности «кардиология». С 1995 года по настоящее время заведующий отделением Волгоградского областной. кардиологического центра, а с 1998 года - заведующий кафедрой кардиологии с функциональной диагностикой ФУВ ВолГМУ.
Указом президента РФ "О награждении государственными наградами Российской Федерации", профессору Юрию Михайловичу Лопатину присвоено почетное звание "Засуженный врач Российской Федерации", отметившее его заслуги и многолетнюю работу в области здравоохранения.