Окончил в 1974 году педиатрический факультет 2 МОЛГМИ им. Н.И. Пирогова. После окончания института работал врачом-реаниматологом в Морозовской больнице. В 1985 г. защитил кандидатскую диссертацию «Диагностика и лечение острой гепатоцеребральной недостаточности при острых нейротоксикозах у детей». В 1986 г. становится ассистентом кафедры поликлинической педиатрии, 1990 г. – доцентом. С 1990 по 1994 гг. работал приглашенным профессором на кафедре педиатрии Ганнемановского университета, Филадельфия, США. В 1995 г. защитил докторскую диссертацию «Диагностика, клиника, патогенез и направленная иммунотерапия эндотоксемии у детей». В 1995 г. - профессор кафедры, в 2004 году - заведующий кафедрой поликлинической педиатрии.
В 2008 году на базе кафедры Б.М. Блохин создает научно-исследовательскую лабораторию «Клиническое моделирование в неотложной педиатрии», где проводится разработка интерактивных тренингов с имитационным моделированием, ситуационное обучение, проведение сравнительных исследований оценки эффективности различных методов обучения в педиатрии
Под руководством и участием Блохина Б.М. в ВКНЦ РАМН была разработана технология получения моноклональных антител к эндотоксину для диагностики и лечения эндотоксического шока и сепсиса, получены авторские свидетельства на изобретения.
Профессор Б.М. Блохин является одним из ведущих специалистов в мире в области неотложных состояний у детей. Член Исполкома Союза педиатров России, инициатор создания и председатель Российского общества по Неотложной педиатрии, председатель Европейской рабочей группы по симуляционному обучению неотложных состояний в педиатрии. Член комитета по образованию международного общества по симуляции в педиатрии (IPSS), член Правления Российского общества симуляционного обучения в медицине (РОСОМЕД).
Главный научный сотрудник НИИ фундаментальных и прикладных биомедицинских исследований. Научный руководитель Детского медицинского центра ГМУ Управления Делами Президента РФ.
