Круг научных интересов О.Б. Щукиной включает в себя проблемы воспалительных заболеваний кишечника – язвенного колита и болезни Крона.
О.Б. Щукина является постоянным лектором Национальной Школы гастроэнтерологов, гепатологов. Регулярно выступает с научными докладами на ежегодных Российских Гастроэнтерологических Неделях, читает лекции по актуальным проблемам гастроэнтерологии на различных семинарах, проводимых для практических врачей.