Получил начальную медицинскую степень в Карловом университете в Праге. Был квалифицированным кардиологом в Великобритании более 25 лет. У Ян Ковача обширная практика, охватывающая всю клиническую кардиологию, и обширный процедурный опыт в качестве одного из крупнейших операторов в области коронарной ангиопластики, стентирования, а также структурных вмешательств на сердце, таких как замена и ремонт клапанов замочной скважины, закрытие дефектов перегородки сердца и лечение осложнений фибрилляции предсердий. Является мировым пионером и лидером в области минимально инвазивных вмешательств на сердце (TAVI, LAA, митральные процедуры). Возглавляет Европейское общество кардиологов в качестве председателя Совета по инсульту.